У меня недостаточно миль для покупки билета на одном счете. Можно ли использовать два счета S7 Priority для оплаты?

Нет, так сделать не получится. Правила программы запрещают платить за билет с разных счетов. Вы можете докупить мили, оплатить одну часть билета рублями, а другую — милями или перевести нужное количество с одного счета на другой. Сделать это можно в личном кабинете.